De 34-jarige verdediger was aanvoerder van de nationale ploeg van het land van de Rijzende Zon op de WK's van 2002 en 2006. Hij speelde in 2007 en 2008 in Oostenrijk voor Red Bull Salzburg. Daarbuiten was hij enkel actief in de Japanse competitie. Er lag een contract voor hem klaar bij Vissel Kobe en ook bij een grote club in Thailand, maar Miyamoto heeft gezegd dat zijn besluit definitief is.
Batman, zoals zijn bijnaam luidt, krijgt een taak bij de Japanse voetbalbond. Hij wordt technisch directeur en moet proberen om het voetbal in het land weer naar een hoger niveau te brengen. Zijn bijnaam deed Miyamoto op tijdens het WK van 2002, toen hij met een zwart masker speelde. Daarmee beschermde hij zijn gebroken neus. Japan bereikte toen de laatste zestien.
"Ik denk niet dat er voor mij op het veld nog een grote rol ligt", vertelde hij tijdens een ingelaste persconferentie. In september gaat hij ook een speciale cursus van tien maanden bij de FIFA volgen. Een zogenaamd Masterprogramma voor 'allround managers die de complexe sportwereld kunnen dienen'. "Ik wil op deze wijze de status van het Japanse voetbal omhoog brengen."

