De sluitpost begon zijn profcarrière in 1993 bij Sparta en kwam verder uit voor VVV-Venlo, FC Utrecht en FC Dordrecht. Daarnaast was hij een half seizoen lang tweede doelman bij PSV. In het seizoen 2002/2003 kwam hij twee keer in actie als stand-in voor Ronald Waterreus. Van de 322 competitiewedstrijden kwam Kooiman in totaal 187 keer uit voor de Spartanen.

