Xhaka speelt al zijn gehele profcarrière voor FC Basel. Met de club van onder meer voormalig Feyenoorder Jean-Paul Boëtius kroonde de Albanese international, die zowel in de verdediging als op het middenveld uit de voeten kan, zich vorig seizoen tot landskampioen van Zwitserland.
In de nieuwe verbintenis is een optie voor nog een extra seizoen opgenomen. Het oude contract van Xhaka liep tot de zomer van 2018. Zijn broer is de Zwitserse international Granit Xhaka.