Onder het bewind van Louis van Gaal kwam de Uruguayaan tot elf optredens in de hoofdmacht van The Red Devils. Mourinho gunt Varela echter geen speelminuten en wil hem eerst aan het werk zien in Duitsland. Eerder deed de Zuid-Amerikaan op huurbasis ervaring op bij Real Madrid Castilla.
Varela maakt sinds de zomer van 2013 deel uit van de selectie van The Mancunians. Toenmalig manager David Moyes haalde hem toen naar Old Trafford. De Engelse topclub nam Varela destijds over van Peñarol. Bij Eintracht Frankfurt wordt hij een collega van de Nederlander Luc Castaignos.